Az iskolakert létesítésekor fogalmazzuk meg a céljait, mert azok meghatározzák az iskolakert kialakítandó típusát is. A cél természetesen az ismeretek átadása és a nevelés. Ezen belül több irányba el lehet indulni. Születtek már olyan kertek, melyeket az agrártörténet tanítására használtak. Előfordultak olyan iskolakertek is ahol a fő hangsúly a szabadidő hasznosítására került, de épült iskolakert árutermelésre, virágtermesztésre is.

Ma alapvető cél inkább az ökológiai ismeretek elsajátítása, vagyis az élőlények és környezet kapcsolatainak vizsgálata. Emellett a tankert előteremti a biológia oktatás anyagát is. Manapság kezd újra divatba jönni konyhakerti gazdálkodás, egy iskolakert kiváló alapja lehet az otthon hasznosítható kertészkedési ismeretek átadására. Mindezen célokban a közös a szociális nevelés, a munka megszerettetése, értékteremtés. Ezek a célok nem különíthetők élesen egymástól egy iskolakert alapításánál, így annak típusai között is lehetnek átmenetek.